Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PUDPQ08623 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUDPQ08623 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms