Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms