Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLEQ07864 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLEQ07864 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLEQ07864 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLEQ07864 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLEQ07864 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms