Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIGFQ07326 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms