Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAD51Q06609 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAD51Q06609 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms