Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms