Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EMX2Q04743 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms