Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARDQ03181 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARDQ03181 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms