Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLOD1Q02809 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms