Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTN2Q02246 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms