Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF17Q02223 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms