Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC6A3Q01959 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms