Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFKB2Q00653 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms