Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ASIC1P78348 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASIC1P78348 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms