Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms