Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNRPD2P62316 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms