Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCS1P62166 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCS1P62166 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCS1P62166 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms