Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM3BP58499 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms