Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP1P56182 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP1P56182 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP1P56182 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP1P56182 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms