Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GFRA1P56159 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms