Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BGRP55822 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3BGRP55822 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms