Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFDNP55196 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms