Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MVDP53602 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MVDP53602 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MVDP53602 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MVDP53602 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MVDP53602 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVDP53602 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVDP53602 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVDP53602 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms