Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOSBP53539 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOSBP53539 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOSBP53539 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOSBP53539 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOSBP53539 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms