Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKX2-5P52952 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-5P52952 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms