Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNA4P52798 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms