Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms