Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB9AP51151 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB9AP51151 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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