Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETV1P50549 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETV1P50549 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETV1P50549 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms