Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX2P50458 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX2P50458 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LHX2P50458 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LHX2P50458 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LHX2P50458 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX2P50458 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX2P50458 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LHX2P50458 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms