Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MRE11P49959 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRE11P49959 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRE11P49959 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms