Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP4P49662 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CASP4P49662 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP4P49662 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CASP4P49662 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms