Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRT6CP48668 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT6CP48668 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms