Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2AP48426 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms