Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME1P48163 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME1P48163 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME1P48163 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME1P48163 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME1P48163 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms