Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTRNP46939 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTRNP46939 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTRNP46939 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms