Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A1P43005 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A1P43005 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms