Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJC1P36383 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJC1P36383 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJC1P36383 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms