Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

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Length 906 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB2P35606 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB2P35606 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COPB2P35606 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPB2P35606 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
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