Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTPDP35247 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms