Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC1P33527 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms