Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIBADHP31937 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms