Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA7P31268 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA7P31268 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms