Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TSPOP30536 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPOP30536 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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