Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNGA1P29973 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNGA1P29973 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms