Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP1P29466 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP1P29466 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP1P29466 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms