Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A5P29400 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A5P29400 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms