Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD10P28358 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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