Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTFRP26992 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms