Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGB2P26583 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms